简短回答
报关单上的数量和重量必须是真实数字，不能简单照抄装箱单。处理思路按发现的时间来分：
- 报关前就怀疑有差异：可以向海关申请在监管状态下先开箱查验，核实后按实际数量申报。
- 查验时被海关发现：实际比申报多的，多出部分可能被认定为未办理海关手续的货物，后果最重；实际比申报少的，主要是申报不实的问题，多缴的税可以申请退还。
- 提货后自己称重才发现：少了的，向供应商或保险公司索赔，并视情况申请退税；多了的，尽快主动补报。
正常的磅差（例如钢卷的理论重量与实际过磅重量的差异）要在合同里约定计价规则，并且在报关时说明计重口径。
规则和依据
- 报关单内容：《海关法》B.E. 2560（2017）第 52 条要求报关单至少列明货物种类、数量、重量、品质、完税价格和原产国。
- 报关前先查看货物：第 54 条规定，进口商因无法掌握货物的完整资料而无法制作报关单时，可以申请开箱查验仍在海关监管下的货物。获准后 30 日内仍未报关、缴税或提供担保的，货物视为滞留货物。
- 未报关货物：第 242 条规定，未经海关手续进口货物的，可判最高 10 年监禁，或处货物价值（含税）4 倍的罚金，货物没收。第 252 条规定该罪不以故意为要件。按海关 2017 年和解准则，与合规货物一起进口、隐匿逃避查验的货物，罚少缴税款的 4 倍，并可没收。
- 申报不实：第 202 条，最高罚款 50 万泰铢。
- 退还多缴的税款：第 25 条规定，进口商可在货物进口之日起 3 年内申请退还多缴的税款。
- 保税仓库的数量差异：第 125 条规定，保税仓库或货栈内的货物数量与存入时的申报不符、又没有正当理由的，差异部分视为未办海关手续的货物。
来源：泰国海关厅：Customs Act B.E. 2560 (2017) 英文非官方译本、Tilleke & Gibbins：Thailand Amends Settlement Guidelines for Customs Disputes
怎么处理
- 发货前约定口径：合同和发票写明按理论重量还是实际过磅重量计价，允许的溢短装比例是多少，以及装箱单按毛重还是净重填写。
- 到港后怀疑有差异：让报关行按第 54 条申请在海关监管下开箱或过磅，取得实际数据后再申报。不要先按装箱单报了再说。
- 报关单已经提交、还没放行：立即通过报关行向口岸海关说明情况，按海关的要求修改申报。修改的具体程序以海关公告和口岸的执行为准。
- 已经放行后才发现：
- 实际多于申报：尽快主动补报，补缴税款；
- 实际少于申报：在 3 年内申请退还多缴的税款，同时凭理货报告、过磅单向供应商、承运人或保险公司索赔。
- BOI 物料：报关数量、BOI 放行函上的数量和入库数量要一致。有差异的，按实际数量调整 RMTS 记录，或者向 BOI 说明。
常见错误和风险
- 少报数量以少缴税：一旦被查出，适用《海关法》第 243 条的逃税处罚，或第 242 条的未报关处罚，后者可能没收货物。
- 装箱单上的毛重、净重混用：按重量计征的税款会算错。即使按价值计征，数量对不上也会引起海关怀疑。
- 长期存在的磅差没有政策：每票都对不上，在稽查中会被逐票追究。
- 滞纳金：补缴的税款按第 22 条每月加收 1%。