简短回答
这个问题有两层，要分开看：
- 商业损失谁来赔：看采购合同和贸易术语（Incoterms）。按 FOB 或 CIF 成交的，货物风险在装运港装船时就转移给了买方，运输途中的短少，一般由买方向承运人或保险公司索赔；装货前就少装的，是供应商的责任。按 DAP、DDP 成交的，货物送达前的风险由卖方承担。
- 海关责任谁来担：不管商业上最后由谁赔，对泰国海关来说，进口商都是申报人和纳税人。短少部分要按实际情况处理报关数据，多缴的税款可以申请退还。泰国工厂不能因为“是供应商少装的”，就让报关单上的数字和实物长期对不上。
规则和依据
- 申报义务：《海关法》B.E. 2560（2017）第 51 条和第 52 条要求进口商正确申报货物的种类、数量、重量和价值。第 202 条规定，申报不实最高罚款 50 万泰铢，且不以故意为前提（第 252 条）。
- 报关前核实：第 54 条允许进口商在报关前申请开箱查验仍在海关监管下的货物。
- 退税：第 25 条规定，多缴的税款可在货物进口之日起 3 年内申请退还；纯属计算错误的，海关可在 2 年内主动退还。
- 不可抗力造成的损失：第 128 条规定，在运往保税仓库途中、在许可码头装卸期间，或在保税仓库存放期间，因不可抗力或无法避免的意外丢失、损毁的进口货物，关长可以免征或退还关税。
- BOI 物料：BOI 第 Por. 5/2543 号公告把进口过程中发生的损失也列入“损耗”范围，企业可申请核减原材料账。BOI 第 Por. 3/2556 号公告规定，各批进口的累计数量不得超过获批数量。
来源：泰国海关厅：Customs Act B.E. 2560 (2017) 英文非官方译本、BOI：Announcement No. Por. 5/2543（英文非官方译本）、BOI：Announcement No. Por. 3/2556（英文非官方译本）
怎么处理
- 当场取证：开柜时拍照、录像，核对铅封号；过磅取得磅单；需要时请第三方检验机构出具短重报告。整柜短少的，在提货时就让码头或承运人签注异常。
- 判断短少发生在哪个环节：铅封完好、箱内无异常的，多半是供应商装货时就少装了；铅封破损或包装破损的，可能是运输途中出的问题。
- 处理海关这一边：
- 还没报关的，按实际数量申报；
- 已按发票数量报关缴税的，整理证据，在 3 年内申请退还多缴的税款。
- 处理商业索赔：
- 供应商责任：要求补发、开具贷项通知单（Credit Note）或扣款；补发的货物要另行报关；
- 运输途中丢失：在提单或保险条款规定的时效内，向承运人或保险公司索赔。
- BOI 物料：BOI 放行函是按发票数量开的，短少部分要按实际数量处理，必要时按 Por. 5/2543 申请核减，以免 RMTS 余额虚高。
常见错误和风险
- 让供应商下批“多发一点补上”：多出的数量如果不如实申报，就是未报关货物，适用《海关法》第 242 条，可处货物价值（含税）4 倍的罚金，并没收货物。
- 短少记在内部账上，海关和 BOI 的数据不改：账实长期不符，稽查时很难解释。
- 合同里没有约定溢短装比例和计重方法：每次都要重新谈，索赔无据可依。
- 超过退税时效：错过 3 年的期限，多缴的税款就拿不回来了。